自上世纪开始，科研体制开始全面改革，基金（基金项目可行性研究报告）制、合同制、同行评议等制度陆续推出，都没有从根本上解决科研经费管理中存在的问题。1999年，课题制开始试行，作为配合，财政部、科技部等四部门发布了《国家科研计划实行管理的规定》，核心是经费管理。“科研人员激励计划”将通过完善工资水平决定机制、改进科研项目及其资金管理、健全绩效评价和奖励机制三个层面激励科研人员。
科研人员的激励计划，涉及最基本的收入分配制度改革，不能单纯谈收入问题。每个科研单位都有自己的特点，不能一刀切，统一来规定，但是至少国家现在意识到了问题，正在推进改革。
现有科技资源配置布局不均，东部地区的知名专家手中往往几十个课题，却因为时间和精力问题而无法完成，反之中西部科研人员拿个课题难上难；课题立项和审核过程存在制度缺陷，甚至出现腐败；科研项目管理费用预算复杂，存在不合理现象，束缚了科研人员的手脚。